邓太后虽为一妇女，但自小修习经史，又在后宫时曾受经书于班昭，其后亦常诵读，因此颇熟习于治术，她的统治在许多方面甚为成功。在后宫，她一反阴后对其他妃子的忌视，对于和帝的其它贵人甚为优遇。在宫中用度上力行俭约，她罢不合礼之祠官、免遣不少宫人，并减少衣食宴乐上的各种花费。在刑狱上精明体察，常能破除冤情；在学术上，邓太后除本身甚为好学外，亦努力奖掖学术，曾召集学者于在东观校对传记；在用人上，太后及邓骘皆引用许多名士如杨震等人。其摄政期间时值羌乱大起，且天灾不断，造成盗贼四起，民不聊生，每有灾，邓太后多自行节俭以救灾。

在统治方法上，虽然她本身具有政治能力，但她以一个女性的身份，不便随时抛头露面，故常身在后宫，必须用一些私近的人为助。她大量任用其兄弟，先以其兄邓骘为车骑将军辅政，后又为晋升大将军，常留禁中，有大事常与之商量，其它的兄弟如邓悝、邓弘、邓阊等亦居官封侯，成为邓太后统治上的助手。

邓太后虽重用外戚，却了解到必须要管理使他们守法守分。她曾诏告京师一带各长官，对邓氏犯错不要宽假。其后，邓太后也下诏让一些皇室子弟与邓氏子弟一同开学校，教经书，并亲自督导，希望能防止其子弟们生活过于骄逸。而邓骘等外戚亦多恭顺节俭，力谋为国，因此外戚并未成为祸患。

除了外戚之外，邓太后也重用了不少宦官如蔡伦等人为助，以他们来传达内外消息，而较少直接见公卿大臣，当时虽尚未有宦宫乱政的情形出现，却也造成他们的权力逐渐增加，为东汉后来的政治带来不好的影响。

尽管邓太后具有统治的能力，且邓氏亦多安分守己，但按中国的传统来说，她是属于不应「牝鸡司晨」的妇女，且又多重用私近之人，再加上安帝年纪渐长，早已成年，而太后却迟迟不肯还政于皇帝，这不仅使得一些大臣之中有人不满，连邓氏之中也有人感到畏惧不安。

如当时诸多天灾，不少人以灾异比附人事，认为是太后摄政所致；又如杜根、成翊世均曾上书希望已年长的安帝亲政，太后不仅不听，杜根因此被扑杀于殿中，幸被救未死，而成翊世也因此而获罪；而太后堂兄邓康忧惧太后久临朝政，先是上劝太后崇公室、损私权，太后不悦而免邓康官。

由朝臣及甚至自家人对于邓太后秉政的不满和忧惧，可见在当时，不论摄政太后的能力如何，太后摄政仍是颇受争议的。而即使实行，也被认为只能是一个因皇帝年幼无法听政的权宜之计。因此当安帝已成年可亲政，而权力却仍操于邓太后之手时，会产生如此多的不满。

也由于累积了如此多的反感，她在永宁二年（121年）死后，尸骨未寒，邓氏家族及其亲信蒙遭冤狱，天下无不为之痛惜。大司农朱宠就认为邓骘乃是无罪遇祸，便用车子载着他的棺材，肉袒上朝，为他鸣冤。接着，众人也多称邓骘冤枉。安帝无奈，将其安葬在洛阳北邙山的祖坟之中。邓骘归葬之日，公卿同吊，莫不悲伤。一直到顺帝即位后，才为邓骘恢复了名誉。