南渡以后。由于汴京已不可守，孟氏遂随高宗南渡至杭州。建炎三年（1129年）苗傅、刘正彦兵变，高宗被迫退位，由年仅3岁的皇太子赵旉继位，因乱军所逼，孟氏再度垂帘听政。孟氏曲加慰抚苗傅等人，并召韩世忠之妻梁红玉，勉令韩世忠速来勤王。后来，乱事平定，再度撤帘。

当初汴京城破，宋皇室几乎全数被俘北迁，孟氏与高宗是极少数幸免者，在绍兴十二年（1142年）高宗生母韦太后自金国放归以前，孟氏一直是当时宋室母仪之代表。高宗南渡不久，金人复南侵，于是高宗乘船入海，孟氏则是向江西逃亡，金人一再追击，孟氏随行兵众溃散，甚至到了要以农人抬轿的窘境。高宗知道孟氏处境后即谓“朕初不识太后，自迎至南京（应天府），爱朕不啻己出。今在数千里外，兵马惊扰，当亟奉迎，以惬朕朝夕慕念之意。”因此派人迎至高宗行宫所在。

孟氏性情恭谨，没有什么不好的事见闻于朝廷。又喜欢饮酒，高宗认为越酒不好喝，命人另外再买甜酒，孟氏就差人去付帐，不曾强取而不付酒钱。在宫中曾觉头晕目眩，有宫人自称会用符水治病，孟氏想起了年轻时的遭遇，马上命令将这个宫人赶出宫外。

绍兴元年（1131年）孟氏去世，谥昭慈献烈皇后，葬会稽县上皇村。绍兴三年（1133年）改谥昭慈圣献皇后。

编辑本段北凉孟皇后

孟氏，十六国时期北凉太祖、武宣王沮渠蒙逊的妻子。十六国时期，很多称王的君主其实就是皇帝，他们的妻子封王后，其实就是皇后的规格。另外，北凉第一任凉王段业，史书没有提及他立有王后，只说他的妻儿在后秦的都城长安，所以通常将孟氏认为北凉第一任皇后。

史书对孟皇后的记载只有一个片段，玄始二年（413年）四月，孟皇后作为河西王沮渠蒙逊的贤内助，破获了宦官王怀祖对沮渠蒙逊的刺杀预谋。史书没有明确记载孟王后是否是沮渠蒙逊前三个太子沮渠政德、沮渠兴国和沮渠菩提的生母，但她不应是沮渠牧犍的生母。

沮渠牧犍在位时有一个王太后，但史书没有记载她的姓氏，可能是孟氏，也有可能是沮渠牧犍的生母。如果沮渠牧犍的太后是孟氏，那么在姑臧（今甘肃武威）陷落后，沮渠牧犍被北魏俘虏，北凉灭亡，孟太后就去世在北魏的都城平城（今山西大同）。北魏太武帝仍把她以皇后的礼仪安葬。